当初殷浩过世，大司马桓温派人送信吊唁。殷浩子殷涓不回信，也不去回拜桓温，而和武陵王司马晞来往密切。广州刺史庾蕴是庾希的弟弟，向来和桓温有嫌隙。桓温讨厌殷、庾两家势力强大，想要铲除他们。辛亥，桓温派弟弟桓秘逼新蔡王司马晃诣西堂叩头自列，在皇帝面前供称说自己与司马晞及其子司马综、著作郎殷涓、太宰长史庾倩、掾曹秀、舍人刘强、散骑常侍庾柔等共同谋反；简文帝流下眼泪，桓温将他们都抓起来交付给廷尉。庾倩、庾柔都是庾蕴的弟弟。癸丑，桓温杀了东海王的三个儿子及其生母。甲寅，御史中丞谯王司马恬秉承桓温意旨，请皇帝依法诛杀武陵王司马晞。皇帝下诏说：“这样诛杀亲族的事，令人悲哀惨痛，不是我所忍听闻的，何况是亲手做呢？此事再详加商议。”司马恬是司马承的孙子。乙卯，桓温再次上表坚持要求杀司马晞，言词迫切。简文帝赐桓温手诏说：“如果晋朝的国祚还长，桓公就遵行我上道诏书的意思吧；如果晋室大运已去，请让我退位让贤。”桓温看到以后，汗流浃背，变了脸色，转而请求废黜司马晞及三子，家属流放到新安郡。丙辰，下诏免新蔡王司马晃为庶人，流放衡阳；殷涓、庾倩、曹秀、刘强、庾柔都被灭族，庾蕴服毒而死。庾蕴的哥哥东阳太守庾友的儿媳是桓温弟弟桓豁的女儿，所以得到桓温特赦。庾希听到此事，和弟弟会稽王参军庾邈以及儿子庾攸之逃到海陵的湖泽中。

温既诛殷、庾，威势翕赫，侍中谢安见温遥拜。温惊曰：“安石，卿何事乃尔？”安曰：“未有君拜于前，臣揖于后。”

翕（xī）赫：显赫。

谢安：字安石，出身士族，东晋名臣。

桓温杀了殷、庾之后，威势显赫，侍中谢安看见桓温远远就拜下去。桓温惊道：“安石，你为什么这样做？”谢安道：“君王尚且叩拜于前，臣下哪有以平礼相见的道理？”

（咸安二年七月）甲寅，帝不豫，急召大司马温入辅，一日一夜发四诏。温辞不至。

不豫：身体不适，生病。

咸安二年（372）七月甲寅，简文帝生病，急召大司马桓温入京，一日一夜连发四道诏书。桓温推辞不去。

己未，立昌明为皇太子，生十年矣。以道子为琅邪王，领会稽国，以奉帝母郑太妃之祀。遗诏：“大司马温依周公居摄故事。”又曰：“少子可辅者辅之，如不可，君自取之。”侍中王坦之自持诏入，于帝前毁之。帝曰：“天下，傥来之运，卿何所嫌！”坦之曰：“天下，宣、元之天下，陛下何得专之！”帝乃使坦之改诏曰：“家国事一禀大司马，如诸葛武侯、王丞相故事。”是日，帝崩。